在进水含盐量变化范围在2000~6000mg/L，设计一级两段的反渗透处理系统时，两段之间的平均通量差别很大。两段通量的不平衡，有时会发生净驱动力（NDP）不足的现象，造成使得一段的第一支膜通量太高，很容易受污染；而二段通量太低，流速太低，很容易结垢。这时有三种解决方法：
       1、在每个段间加增压泵，以提高后段的驱动力。采用这个方法时，会增加投资成本和运行电耗。
       2、在第一、第二段产水侧设置节流阀门，通过增加产水背压的方式，降低前段产水量，保持整体有效压力（NDP）的均衡。采用这个方法时，系统停止运行时有可能造成背压（产水侧压力＞进水侧压力），在设计以及操作时必须谨慎处理。
       3、前后各段采用不同过滤阻力的膜元件。前段采用阻力大的膜元件，例如：PROC10或CPA3-LD，甚至SWC系列海水淡化膜元件，人为降低前段的产水量，后段采用阻力小的膜元件，例如ESPA系列，以保证产水量。采用这个方法，在不增加投资的情况，不仅平衡了两段的产水量，降低了污染和结垢的可能，也没有背压破坏的风险。